按加工方法分類
1.木化石原石：就是沒經(jīng)過任何人工加工過的木化石。市場上這種樹化玉比較難找，因?yàn)橹挥行螤钐貏e好的樹化玉才不拿去加工，而形狀特別好的又很少見。
2.剝皮打磨拋光木化石：由于木化石本身是樹的化石，樹都有樹皮的，這些樹皮顏色發(fā)白枯燥很不好看，只有把這一層表面樹皮剝掉，再打磨拋光出來，才顯示出木化玉的美。
3.噴砂加工木化石：當(dāng)木化玉拿去打磨拋光時(shí)，由于加工工具的局限性，會完全改變了這個(gè)木化石的自然形狀。近幾年來，人們想出了用金剛砂高氣壓噴射到樹化玉表面，把表面的樹皮、雜質(zhì)噴掉，留下其中的玉化層。這樣就使木化石保持原始的自然形狀，又能表露出木化石內(nèi)部玉化的精美。不過，由于2010年噴砂工藝的限制，這種方法加工出來的木化石要噴上水或蠟水，才能達(dá)到打磨拋光料的光潔度。
按礦物學(xué)分類
礦物學(xué)分類為：石英木化石、玉髓木化石、蛋白石木化石。以石英為主，其次玉髓，蛋白石十分稀少。
從木化石的殘余結(jié)構(gòu)分析，部分蛋白石木化石己轉(zhuǎn)變?yōu)槭⒛净?，尚見脫水作用下的彎曲裂隙殘留。中生代時(shí)期形成的蛋白石木化石，由于時(shí)間長遠(yuǎn)，應(yīng)力作用、熱力作用及陳化，現(xiàn)已轉(zhuǎn)變成石英木化石，只有新生代的蛋白石木化石才得到保存。
按顏色分類
1.白色木化石：礦物純凈度高，粒度均勻，組成單一，細(xì)胞殘留色淺，細(xì)胞壁殘留物極少，細(xì)胞形態(tài)主要從石英、玉髓交代、充填、堆積形成的細(xì)胞輪廓判斷。樹種多以水杉，銀杏等非產(chǎn)樹脂性植物為主，后期浸染作用微弱。白色木化石較少見。
2.灰色木化石：礦物純凈度高，粒度均勻，組成單一，細(xì)胞殘留色深，細(xì)胞壁殘留物較多，細(xì)胞形態(tài)主要從石英、玉髓交代、充填、堆積形成的細(xì)胞輪廓及明顯的細(xì)胞壁判斷。樹種多以水杉，銀杏等非產(chǎn)樹脂性植物為主，后期浸染作用較強(qiáng)?；疑净Ｒ?。
3.黃色木化石：礦物純凈度高，粒度均勻組成單一，細(xì)胞殘留色深，細(xì)胞壁殘留物較多，樹種多以松，柏等產(chǎn)樹脂性植物為主，黃色在木化石中分布均勻，里、外一致，與原始木質(zhì)相關(guān)，黃色木化石常見。另一種黃色木化石。由于Fe2O3的黃色礦物相的浸染作用，使木化石呈顯黃色，這種黃色是不均一的，有淺深之分。
4.褐色木化石：礦物純凈度高，粒度均勻組成單一，后期氧化鐵質(zhì)浸染并深入細(xì)胞，殘留色淺―深，細(xì)胞壁殘留物少―較多，各樹種均有。受Fe2O3的褐色礦物相浸染，使木化石呈顯褐色。在木化石中整體呈褐色者少見，大多數(shù)呈斑塊狀、花斑狀或一團(tuán)團(tuán)的分布。
5.紅色木化石：礦物純凈度高，粒度均勻組成單一，后期氧化鐵質(zhì)浸染并深入細(xì)胞，受Fe2O3的紅色礦物相浸染，使木化石呈顯紅色。在木化石中整體呈紅色者少見，大多數(shù)呈斑塊狀、花斑狀或一團(tuán)團(tuán)的分布，當(dāng)木化石中充填、交代物為玉髓質(zhì)時(shí)，常展現(xiàn)一種似瑪瑙狀的外貌。
6.綠色木化石：礦物純凈度高，粒度均勻組成單一，后期CuC03質(zhì)浸染并深入細(xì)胞，受CuC03浸染，使木化石呈顯綠色?？兹甘时∧罡街谀净砻婕傲严吨?，在木化石中常成片分布，也呈斑塊狀、花斑狀出現(xiàn)。
? ? ? 形成時(shí)間
硅化木從古生代石炭紀(jì)開始(始于距今3.55億年)到中生代白堊紀(jì)(結(jié)束于距今6500萬年)之間均有分布。到21世紀(jì)為止最早的木化石是石炭紀(jì)早期的裸蕨植物化石，最新的為6500萬年前白堊紀(jì)晚期的硅化木。
形成原因
古代樹木因火山噴發(fā)或地殼運(yùn)動等地質(zhì)作用而被埋入地下，由于處于缺水的干旱環(huán)境或與空氣隔絕，木質(zhì)不易腐爛，在漫長的地質(zhì)作用過程中被含硅鈣物質(zhì)交換替代，替換的過程保留了木質(zhì)的纖維結(jié)構(gòu)和樹干的外形，使樹木變成化石。
樹木保存為化石的條件極為苛刻，樹干要想成為硅化木，先決條件是其樹干必須得到迅速掩埋，環(huán)境的特殊，與空氣隔絕這種迅速掩埋的情況畢竟是極少見的，因此，樹木成為化石的幾率非常小。
樹木被泥沙埋藏后，含豐富硅質(zhì)成分的地下水溶液一邊溶解樹木的木質(zhì)成分，一邊將自己攜帶的硅質(zhì)成分沉淀于所溶解的孔洞中，發(fā)生物質(zhì)交換替代現(xiàn)象。如果溶解和交替速度相等，且以分子相交換，則可保存樹木的微細(xì)結(jié)構(gòu)，如年輪及細(xì)胞輪廓等。如交替速度小于溶解速度，則主要保存了樹木的形態(tài)，年輪一般不清楚。
最后，樹木的原來成分已蕩然無存，全部由含硅鈣成分的石質(zhì)所取代。之后，經(jīng)過壓實(shí)、固結(jié)、成巖，原來的樹木就完全變成了堅(jiān)硬的石頭木化石。
硅化木其形成的主要原因：
木的石化是要經(jīng)過將原先組織用分解的礦物加以替換這一程序，這礦物通常是指硅或鈣。在壓力和溫度的雙重作用下，硅與其分解時(shí)的雜質(zhì)組合在一起再次結(jié)晶，通常會導(dǎo)致新的礦物形式出現(xiàn)。硅再度結(jié)晶會將木的結(jié)構(gòu)加以破壞。